MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 4409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	GAG	2	6	197	202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937460
2	NC_013924	CAA	2	6	208	213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937460
3	NC_013924	GAT	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937460
4	NC_013924	GAG	2	6	395	400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937460
5	NC_013924	ACG	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937460
6	NC_013924	TCACGA	2	12	423	434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289937460
7	NC_013924	GAG	2	6	512	517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937460
8	NC_013924	CGA	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937460
9	NC_013924	CGG	2	6	586	591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937460
10	NC_013924	CGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937460
11	NC_013924	GAC	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937460
12	NC_013924	GCA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937460
13	NC_013924	ATC	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937460
14	NC_013924	AC	3	6	762	767	50 %	0 %	0 %	50 %	289937460
15	NC_013924	ATG	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937460
16	NC_013924	GAC	2	6	854	859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937460
17	NC_013924	CGT	2	6	874	879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937460
18	NC_013924	TG	3	6	885	890	0 %	50 %	50 %	0 %	289937460
19	NC_013924	CTT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937460
20	NC_013924	CTC	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937460
21	NC_013924	GTC	2	6	1091	1096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937460
22	NC_013924	CAC	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937460
23	NC_013924	AAAC	2	8	1133	1140	75 %	0 %	0 %	25 %	289937460
24	NC_013924	ATC	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937460
25	NC_013924	TGG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937460
26	NC_013924	CTA	2	6	1285	1290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937460
27	NC_013924	CTT	2	6	1403	1408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937460
28	NC_013924	CGG	2	6	1809	1814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937461
29	NC_013924	TGG	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937461
30	NC_013924	GTG	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937461
31	NC_013924	ACG	4	12	1938	1949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937461
32	NC_013924	GTAC	2	8	1951	1958	25 %	25 %	25 %	25 %	289937461
33	NC_013924	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937461
34	NC_013924	TGT	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937461
35	NC_013924	GC	3	6	2058	2063	0 %	0 %	50 %	50 %	289937461
36	NC_013924	CGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937461
37	NC_013924	CGT	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937461
38	NC_013924	CTG	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937461
39	NC_013924	GAA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289937461
40	NC_013924	GGC	2	6	2225	2230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937461
41	NC_013924	GCG	2	6	2272	2277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937461
42	NC_013924	GAACTC	2	12	2301	2312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289937461
43	NC_013924	GCA	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937461
44	NC_013924	GAG	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937461
45	NC_013924	GCTG	2	8	2420	2427	0 %	25 %	50 %	25 %	289937461
46	NC_013924	CTG	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937461
47	NC_013924	ATC	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937461
48	NC_013924	GTT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937461
49	NC_013924	TGA	3	9	2729	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937461
50	NC_013924	ATC	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937462
51	NC_013924	ATC	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937462
52	NC_013924	CGT	3	9	2974	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937462
53	NC_013924	TCG	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937462
54	NC_013924	TTTG	2	8	2995	3002	0 %	75 %	25 %	0 %	289937462
55	NC_013924	GAT	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937462
56	NC_013924	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937462
57	NC_013924	TGGG	2	8	3162	3169	0 %	25 %	75 %	0 %	289937462
58	NC_013924	AGG	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937462
59	NC_013924	TCG	2	6	3279	3284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937462
60	NC_013924	GAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937462
61	NC_013924	TCG	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937462
62	NC_013924	TCA	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937463
63	NC_013924	GTT	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937463
64	NC_013924	CGC	2	6	3697	3702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937463
65	NC_013924	GATC	2	8	3792	3799	25 %	25 %	25 %	25 %	289937463
66	NC_013924	TTG	2	6	3824	3829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937463
67	NC_013924	GCGAT	2	10	3848	3857	20 %	20 %	40 %	20 %	289937463
68	NC_013924	CT	3	6	3913	3918	0 %	50 %	0 %	50 %	289937463
69	NC_013924	GGC	2	6	3919	3924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937463
70	NC_013924	CTC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937463
71	NC_013924	AC	3	6	4081	4086	50 %	0 %	0 %	50 %	289937463
72	NC_013924	TGC	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937463
73	NC_013924	TAT	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289937463
74	NC_013924	CGAC	2	8	4184	4191	25 %	0 %	25 %	50 %	289937463
75	NC_013924	ACGA	2	8	4233	4240	50 %	0 %	25 %	25 %	289937463
76	NC_013924	GTG	3	9	4498	4506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937464
77	NC_013924	GCA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937464
78	NC_013924	GGT	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937464
79	NC_013924	CGAC	2	8	4693	4700	25 %	0 %	25 %	50 %	289937464
80	NC_013924	GTT	2	6	4728	4733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937464
81	NC_013924	AAC	2	6	4857	4862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937464
82	NC_013924	ATC	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937464
83	NC_013924	AAAG	2	8	4884	4891	75 %	0 %	25 %	0 %	289937464
84	NC_013924	CAT	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937464
85	NC_013924	GCT	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937464
86	NC_013924	CGG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937465
87	NC_013924	GTC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937465
88	NC_013924	GACTG	2	10	6593	6602	20 %	20 %	40 %	20 %	289937465
89	NC_013924	TAC	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937465
90	NC_013924	CG	3	6	6613	6618	0 %	0 %	50 %	50 %	289937465
91	NC_013924	ACG	2	6	6622	6627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937465
92	NC_013924	CGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937465
93	NC_013924	TGAC	2	8	6736	6743	25 %	25 %	25 %	25 %	289937465
94	NC_013924	TCG	2	6	6796	6801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937465
95	NC_013924	AAC	2	6	6870	6875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937465
96	NC_013924	GTC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937465
97	NC_013924	GCA	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937465
98	NC_013924	TCC	2	6	6901	6906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937465
99	NC_013924	GA	3	6	6943	6948	50 %	0 %	50 %	0 %	289937465
100	NC_013924	TCG	2	6	6961	6966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937465
101	NC_013924	ACC	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937465
102	NC_013924	AC	3	6	7078	7083	50 %	0 %	0 %	50 %	289937465
103	NC_013924	CTC	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937465
104	NC_013924	CGA	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937465
105	NC_013924	CCA	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937465
106	NC_013924	ATC	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937465
107	NC_013924	CTG	2	6	7422	7427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937466
108	NC_013924	GAC	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
109	NC_013924	CCGA	2	8	7442	7449	25 %	0 %	25 %	50 %	289937466
110	NC_013924	CGGAAC	2	12	7527	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
111	NC_013924	CGGAAC	2	12	7557	7568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
112	NC_013924	CGGAAC	2	12	7587	7598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
113	NC_013924	GACCG	2	10	7639	7648	20 %	0 %	40 %	40 %	289937466
114	NC_013924	CCG	2	6	7750	7755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937466
115	NC_013924	GAC	2	6	7769	7774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
116	NC_013924	GAA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289937466
117	NC_013924	GTC	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937467
118	NC_013924	CGC	2	6	8032	8037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937467
119	NC_013924	CGA	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
120	NC_013924	GGAT	2	8	8176	8183	25 %	25 %	50 %	0 %	289937467
121	NC_013924	GC	3	6	8228	8233	0 %	0 %	50 %	50 %	289937467
122	NC_013924	TGG	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937467
123	NC_013924	CG	3	6	8384	8389	0 %	0 %	50 %	50 %	289937467
124	NC_013924	GCT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937467
125	NC_013924	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937467
126	NC_013924	CGA	2	6	8530	8535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
127	NC_013924	GAT	2	6	8603	8608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937467
128	NC_013924	AGG	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937467
129	NC_013924	CGA	2	6	8641	8646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
130	NC_013924	CAC	2	6	8673	8678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937467
131	NC_013924	TC	3	6	8680	8685	0 %	50 %	0 %	50 %	289937467
132	NC_013924	CTG	2	6	8699	8704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937467
133	NC_013924	GCGA	2	8	8763	8770	25 %	0 %	50 %	25 %	289937467
134	NC_013924	CGC	2	6	8820	8825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937467
135	NC_013924	CGA	2	6	8833	8838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
136	NC_013924	GACAGC	2	12	8877	8888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
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139	NC_013924	CCGA	2	8	9062	9069	25 %	0 %	25 %	50 %	289937467
140	NC_013924	ACC	2	6	9127	9132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937467
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147	NC_013924	GCGTAC	2	12	9317	9328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937467
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152	NC_013924	GAC	2	6	9446	9451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
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154	NC_013924	CGG	2	6	9526	9531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937467
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157	NC_013924	CGA	2	6	9666	9671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
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239	NC_013924	CAA	2	6	14416	14421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937471
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245	NC_013924	CGG	2	6	14615	14620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937471
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251	NC_013924	GAG	2	6	14801	14806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937471
252	NC_013924	TCGTGT	2	12	14831	14842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289937471
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255	NC_013924	GGC	2	6	15188	15193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937472
256	NC_013924	GTC	2	6	15242	15247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937472
257	NC_013924	CGG	2	6	15252	15257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937472
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259	NC_013924	GTC	2	6	15311	15316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937472
260	NC_013924	GCC	2	6	15335	15340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937472
261	NC_013924	CCG	3	9	15342	15350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937472
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377	NC_013924	ACCG	2	8	19508	19515	25 %	0 %	25 %	50 %	289937475
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379	NC_013924	TCGG	2	8	19593	19600	0 %	25 %	50 %	25 %	289937475
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381	NC_013924	GTC	2	6	19677	19682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937475
382	NC_013924	GTC	2	6	19839	19844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937476
383	NC_013924	CGC	2	6	19927	19932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937476
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385	NC_013924	ACA	2	6	20078	20083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937476
386	NC_013924	CGA	2	6	20118	20123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937476
387	NC_013924	TGA	2	6	20138	20143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937476
388	NC_013924	ACC	2	6	20144	20149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937476
389	NC_013924	GAC	2	6	20176	20181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937476
390	NC_013924	CGGTT	2	10	20186	20195	0 %	40 %	40 %	20 %	289937476
391	NC_013924	GCAC	2	8	20216	20223	25 %	0 %	25 %	50 %	289937476
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393	NC_013924	CGTCAC	2	12	20346	20357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937476
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401	NC_013924	TCCG	2	8	20799	20806	0 %	25 %	25 %	50 %	289937476
402	NC_013924	CA	3	6	20860	20865	50 %	0 %	0 %	50 %	289937476
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494	NC_013924	TCC	3	9	27594	27602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937481
495	NC_013924	TCGA	2	8	27605	27612	25 %	25 %	25 %	25 %	289937481
496	NC_013924	CTC	2	6	27659	27664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937481
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499	NC_013924	CGA	3	9	27700	27708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937481
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